微波应用设备可在食品sj、保鲜、干燥、熟化、烘烤、膨化、改性、加速化学反应等方面发挥积极的作用，特别是在食品sj保鲜方面的作用更加受人关注。应用微波技术处理食品具有快速、高效、节能、加热均匀、温度低、无污染、易自动化操作等优点，并可有效的保存食物中的色香味和营养成分。
尽管微波应用设备在食品sj保鲜方面具有重要用途，但微波工业也存在不少问题，影响了微波工业的稳步发展。
1、有些微波设备企业的制造技术不成熟。技术不过关，制造出的微波设备发生微波泄漏问题，既起不到对食品sj保鲜的作用，还会对操作工人的身体健康产生危害。
2、有些微波设备企业夸大宣传。对客户（食品生产企业）宣称，只要采用了微波处理食品，就可达到sj保鲜的效果，把微波设备说成“包治百病”的工具。而事实情况并非如此，不少食品企业使用微波设备后，并没有获得预期的微波sj保鲜效果，原因是这些微波设备企业没有根据不同食品的特性，向客户提供相应的微波sj工艺。因为不同食品所需的sj工艺并不相同，且有些食品并不适合使用微波sj保鲜，如葡萄糖粉等含糖量很高的食品就不宜采用微波处理，否则会被烧煳。
3、未能为客户量身定做微波设备。对食品sj保鲜和干燥而言，微波设备应该是一种非标机械设备，对于不同的食品，微波设备应在微波功率、磁控管排布等方面作不同的设计。sj时间的设定也很重要，利用微波对同样的食品分别处理2分钟和3分钟，sj效果可能相差很大，有时会相差数倍。但有些微波设备生产厂家由于自身的技术水平不高或嫌麻烦，不愿意根据客户所产食品的实际情况来设计、制造，而是提前根据自己的设想做好一批相同的规格的微波设备，然后对不同的客户都称“其微波设备可保证对不同的食品起到良好的sj保鲜和干燥效果”。
4、没有针对性的投放市场。目前，国内有100多家微波设备生产企业，大量没有针对性的微波设备投放市场，由于不能有效地对食品进行sj保鲜、干燥，结果是食品生产企业弃用这些微波设备，既浪费了资源，又给食品企业造成了损失，后果是越来越多的食品企业认为“微波不适合在食品工业中使用”，导致食品企业不相信微波的作用，将不利于微波工业的持续发展。
5、利用新概念误导客户。有些微波设备生产企业推出“微波+紫外线”的组合设备，声称可利用微波和紫外线对食品进行双重sj。其实，这是一种概念的炒作和对食品企业的误导，因为，利用微波对食品进行处理的时间很短，只有几分钟，紫外线的穿透力弱、短时间照射的sj效果并不理想，sj的有效距离也很短，实际是没什么效应的。
缺乏配套的应用技术服务。一些微波设备厂家缺乏食品工艺、食品微生物、食品原配料等方面的知识和技术人才，不能系统分析食品质量问题发生的原因，不能设计出具有针对性的微波设备及合理的sj工艺。食品企业使用这样的微波设备，自然不能获得理想的效果。