在使用秸秆饲料喂牛喂羊的时候，我们的小型养殖户很少去关注秸秆饲料的存储问题，随意堆积的秸秆饲料没有得到正确的保存，一段时间后就会出现发霉发黑的情况，大多数养殖户在遇到这种情况都是继续使用饲喂的，然后这种发黑发霉的饲料对于养殖本来说也是一种变相的负担，会引起一些必要的养殖问题。
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广大农村养殖户利用秸秆资源，储备草饲家畜的过冬饲草和青贮，这对我国畜牧业的发展起到了很大的推动作用。但在应用秸秆饲料的同时，广大养殖户应以科学发展的观点，正确看待农作物秸秆的利用，高度重视秸秆饲料的安全。
1、植物病虫害对秸秆饲料及对草饲家畜的危害玉米青枯病，连作玉米田及高湿、雨后骤晴的情况下发病严重，病菌从根部伤口侵入，使叶片呈灰绿色，萎蔫下垂，并逐渐变黄，根、茎基部呈水渍状后变褐腐烂，潮湿时可见白色或粉红色菌丝。小麦纹枯病、小麦白粉病、锈病、麦圆红蜘蛛等病虫害都对秸秆有害，使秸秆都带病菌和病毒。这些带病菌的秸秆直接饲喂家畜会造成很大的危害。如牛的感光过敏病就是因为采食了大量的致病植物引起的。
2、秸秆本有毒和霉变引起的家畜中毒鲜嫩高粱、玉米秸秆苗和亚麻叶等含氰苷的植物被单胃家畜采食后，可引起qqs。还有些植物具有tr有毒有害物质，如高粱秸秆中的单宁酸和一些植物性原料中的生物碱、游离棉酚、蛋白酶抑制剂等，植酸以及有毒硝基化合物等。这些植物秸秆直接饲喂家畜一定要注意安全适量。霉变的秸秆饲料中毒有黄曲毒素、赤霉菌毒素、曲霉菌等多种毒素，这些毒素既可侵害畜类，又可侵害禽类。症状多为角膜混浊、腹泻、神经紊乱、昏厥。
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3、解决办法。秸秆发酵剂可以解决上述问题。利用秸秆发酵剂对秸秆进行发酵处理，可以达到杀菌杀毒的作用。发酵剂中的有效菌种，在适宜环境下大量繁殖，分解秸秆的同时产生的热量可以是物料达到50—60度高温。在这样的温度下持续几天，秸秆中的病毒、虫卵等均被杀死，家畜可安全食用。另外，用秸秆发酵剂处理秸秆，具有发酵速度快、操作简单、无需辅料即可将各种农作物秸秆转化为高质量饲料等特点。发酵好的饲料呈酒香气，适口性极好，营养成大大增高，能使畜禽生长速度加快，是广大养殖户降本增效，提高经济效益的好帮手。
所以保存秸秆饲料是个很重要的措施，使用好旺农秸秆发酵剂通过发酵处理秸秆，在压实密封的保存条件下，可以帮助秸秆饲料长期保鲜，不会发霉变黑，不流失秸秆饲料的营养成分。
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